bwin必赢迷信家剖析红苹果着色分子机制

来路:苹果资源与育种创新团队  公布日期:2019-04-03  著作人:张利义  

 

4月2日,bwin必赢亚洲苹果资源与育种创新团队完成了基于苹果花培纯系高质量基因组测序的研讨效果。该研讨提醒了反转座子控制红苹果着色的分子机制。相干研讨以题“A high-quality apple genome assembly reveals the association of a retrotransposon and red fruit colour”在《Nature Communications》在线发布。

由于种植苹果通常是二倍体,基因组高度杂合且颠末全基因组复制,致使惯例种类基因组测序组装困难。而该研讨团队临时停止苹果花药纯系培育,创制的一系列种类花培纯系为苹果遗传实际和基因组测序研讨奠基了紧张根底。他们以‘寒富’苹果花培纯系HFTH1为资料,基于三代测序技能停止了全基因组测序,组装了现在天下上最为完好的苹果基因组(contigN50 为6.99M)。以往基因组测序都因此‘金冠’种类为资料,而这个新基因型基因组为天下迷信配合体研讨苹果分子育种提供了新的参考序列。应用与已发布的金冠基因组比拟,取得少量的构造变异,为了解差别基因型苹果遗传多样性、分子标志的开辟和分子育种提供了紧张信息。‘寒富’集抗寒、抗病、抗旱而着名的种类,这一高质量的基因组为以后剖析苹果抗性分子机制奠基了根底,必将极大地促进苹果抗性育种。

果实着色退化是个风趣庞大的题目,该研讨进一步经过比拟基因组学,联合148份苹果天然群体和1个杂交组合别离群体验证,提醒一个Gypsy-like反转座子充任加强子(定名redTE)控制苹果着色。不易着色的种类是由于短少这一加强子,不克不及无效分解花青素的后果。该研讨进一步推测一系列白色芽变的种类是这个转座子与其调控的基因以及等位基因和四周情况惹起表观遗传综合的后果,这无疑增长和丰厚了我们对苹果着色的了解和看法。愈加紧张的是,基于这一反转座子开辟的分子标志,能精准的停止果色事后选择。

该研讨失掉了中国农科院科技创新工程和地方级公益性科研院所根本科研业务费项目的赞助,并与武汉将来组生物科技有限公司协作完成。(通讯员:何文上)

原文网址:

http://www.nature.com/articles/s41467-019-09518-x

 

 


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